Arrestato il 31 ottobre del 2005 nell’operazione “Peronospera III”, Filippo Chirco insieme all’ex ingegnere capo del comune di Marsala, Rosario Esposto e al presunto mafioso Vincenzo Zerilli, si
sarebbe attivato per far aggiudicare all'impresa "Sicilstrade", con un ribasso minimo, l'appalto del secondo stralcio dei lavori per la costruzione del nuovo cimitero di Marsala (importo complessivo: 5 miliardi di lire, di cui 3 miliardi e 571 milioni come base d'asta). I fatti risalgono al settembre del 2001 e l'architetto Esposto, anch'egli arrestato, avrebbe pilotato quella gara in cambio di 50 milioni di lire avuti da Chirco e Zerilli. Assieme ad un altro presunto mafioso, Luigi Adamo, e all'imprenditore Maurizio Errera, Filippo Chirco avrebbe, invece, compiuto un'estorsione in danno del responsabile tecnico di due cantieri, uno per la costruzione di loculi al cimitero di Petrosino, l'altro per il rifacimento di marciapiedi a Marsala.